如何上传质谱原始数据到公共数据库
上传质谱原始数据其实没那么复杂啦!比如说,使用Maxquant软件时,只需要选择上传原始下机的Raw文件和搜库结果文件search。嘿,这里还有个小技巧,你可以把table文件夹里的所有文件都压缩成一个压缩包直接上传,超级方便!而用Proteome Discoverer软件(PD)的时候,则选上传原始Raw文件、蛋白鉴定列表和搜库searchsummary结果就OK啦!
通过以上操作步骤,质谱原始数据就能顺利上传到ProteomeXchange公共数据库,这样不仅方便自己保存数据,也能让其他科研小伙伴们一起分享和再利用,真是双赢呀!

怎么导入数据库到网站和上传数据的详细步骤
- 想先把数据库导入网站,第一步,确认数据库文件放在哪里,得是服务器上能访问的位置哈,可以是本地也可以是网络共享的。
-
接着配置数据库连接,比如用MS Access,如果不需要用户名和密码,配个DSN连接,再用简单的ASP代码就能轻松搞定。
-
对于MySQL数据库,先得在虚拟主机面板上新建数据库,然后登录phpMyAdmin工具。
- 登录时需要输入数据库用户名和密码,那信息是在你新建数据库的时候拿到的。
-
然后选中数据库,点击“导入”功能,把你想导入的文件上传,简单又直接。
-
说到上传原始数据,不得不提的是几个实用工具:
- Aspera插件,先装插件,再按提示上传数据,速度贼快;
- FTP上传,用FileZilla这类软件登录服务器,把数据拖放到指定路径,特别适合批量文件。 -
还有Yii框架的小技巧,如果你网站里的商品数多,肯定想一键导入Excel表格,对吧?试试PHPExcel这个超强插件吧!
-
下载后,只要把Classes文件夹改名成PHPExcel,放到项目里的protected/extensions目录中,然后在代码里调用,轻轻松松搞定数据导入。
-
最后,针对像CNCB这种国家生物信息中心数据库,先得注册账号,填个邮箱啥的,耐心等2-5分钟,确认邮件后立刻上传你的宝贝数据。

相关问题解答
-
质谱数据上传到公共数据库需要注意什么事项吗?
说实话嘛,上传质谱数据时,最重要的是文件格式得对,Raw文件和搜库结果必须同步上传,别漏了哦!还有,压缩文件上传能省不少功夫,特别是Maxquant的table文件夹,这样操作既快捷又稳妥。记得确认网络稳定,别半途断线,咯咯。 -
数据库导入网站时连接失败怎么办?
哎呀,这事儿很常见!首先别慌,先确认数据库文件路径是不是正确,服务器是不是有访问权限,再看看用户名和密码对不对。用的是DSN连接的话,配置也要仔细检查。遇到报错就Google或者翻文档,可能是小小细节没搞对,摸索一下,很快就通了。 -
上传大量数据用什么工具最合适?
其实,Aspera插件简直是神器,专门为大文件量设计,速度杠杠的,比传统FTP快多了!不过要是你比较习惯图形界面,FTP软件FileZilla也不错,操作直观,拖拖拽拽就搞定。要不结合用更稳妥呢,轻松又高效。 -
Excel表格数据怎样快速导入Yii框架的网站数据库?
这个其实不复杂呢!借助PHPExcel插件就能搞定。下载个插件,把Classes文件夹改名后放到extensions目录,调用的时候加上几句代码,马上就能把Excel里的数据批量导进数据库,省了不少人工录入的麻烦。简直是开发者的好帮手,快试试看吧!
新增评论